Arrêt de l'ensemble des services de la plateforme Migale à partir du lundi 3 avril 2017

La plateforme Migale sera indisponible du 3 au 10 avril 2017. Cette indisponibilité est dûe à l'arrêt du DataCenter Ile-de-France qui héberge l'infrastructure de la plateforme.

Merci d'avance de votre compréhension.

Pour toutes questions ou informations supplémentaires, merci de contacter help.migale@jouy.inra.fr.

Protéique


VersionMAJ

findtarget

none2004-05-15DownloadDoc
Findtarget est un outil de comparaison génomique qui permet de cibler des gènes d'intérêts chez un micro-organisme dont le génome est séquencé. Il utilise des données issues de blast.

Remarque
Run Unix # Run Web # http://migale.jouy.inra.fr/outils/findtarget.html

VersionMAJ

orthomcl

2.0.22012-01-31DownloadDoc
OrthoMCl est un logiciel qui construit des clusters d'orthologue à partir de fichiers multifasta contenant des CDS.

Remarque Se placer dans le reépertoire où se trouvent les données et lancer : orthomcl.pl --mode 1 --fa_files "Ath.fa,Hsa.fa,Sce.fa"
Run Unix # orthomcl.plRun Web #

VersionMAJ

TribeMCL

mcl-12-0682012-03-09DownloadDoc
TribeMCL is a method for clustering proteins into related groups, which are termed 'protein families'. This clustering is achieved by analysing similarity patterns between proteins in a given dataset, and using these patterns to assign proteins into related groups.

Remarque
Run Unix # mclRun Web #

Menu principal

Page | by Dr. Radut