Banques de données

Il est généralement admis que les banques de données sont des collections de fichiers alors que les bases de données sont des données structurées à l'aide de logiciels appelés SGBD (Système de Gestion de Bases de Données) comme PostgreSQL, MySQL ou Oracle.

Banques de données

Elles sont consultables au travers de l'interface BioMAJ Watcher.

Bases de données relationnelles

Toutes les bases de données de l'unité sont référencées à cette adresse.

Processus de mises à jour

L'ensemble du processus de mises en ligne des données de la plateforme est supervisé par le moteur de WorkFlow BioMAJ.

Les informations sur les dernières mises à jour sont accessibles en ligne.

Les banques sont téléchargées depuis les sites « originaux » à fréquences régulières. Elles sont ensuite formatées et indexées pour pouvoir être utilisées par l'ensemble des outils de la plateforme (fasta, blast, emboss...).



Certaines banques servent également à la construction de bases de données relationnelles développées dans l'unité MIG (micado et prose).

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