Basic Local Alignment Search Tool

Les outils présentés ici sont parmi les plus couramment utilisés en bioinformatique génomique et protéomique

Les programmes BLAST effectuent une recherche rapide dans les banques de séquences nucléiques et protéiques combinée avec une estimation rigoureuse des statistiques pour apprécier la signification des similitudes.

Version publique avec quelques banques de référence

• BLAST (blastn, blastp, blastx,tblastx,tblastn)
• PSI/PHI BLAST
• Mega BLAST
• BLAST 2 sequences

Accès aux programmes BLAST par unité de recherche (intranet)

• Unité GM
• Equipe Bactéries lactiques - Métabolisme
• Equipe Bactéries lactiques - Etude du stress
• Unité VIM
• Equipe Infection et immunité des poissons
• - Flavobacterium psychrophilum
• - TRIM
• Unité MIG
  • ECOMET
• Unité STLO (INRA - Rennes)
• Unité Microbiologie (INRA - Theix)
• Unité GMPA (INRA - Grignon)

Si vous souhaitez déposer un génome ou des données confidentielles, vous pouvez effectuer votre demande en adressant un message à Franck Samson.

Ce service est réservé aux agents INRA uniquement.

Documentation et/ou aide en ligne

• Readme file