Descriptif de la plateforme Migale

Dans les deux sections suivantes, vous trouverez un descriptif des différentes missions de la plateforme ainsi que de l'équipe qui en a la charge.

Présentation

La plateforme bioinformatique Migale est hébergée au sein de l'unité Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement (MaIAGE).

Elle a pour vocation de fournir des services à la communauté des sciences de la vie à travers quatre niveaux de service :

  • Mise à disposition et maintenance d'une infrastructure informatique de calcul scientifique dédiée au traitement des données des sciences de la vie. Celle-ci comprend un cluster de calcul, des moyens de stockage, la mise à disposition de données publiques ou privées ainsi que des outils bioinformatiques

  • Diffusion d'un savoir-faire en bioinformatique à travers des formations, des tutoriels, du conseil et de l'assistance aux utilisateurs

  • Conception et développement d'applications, que ce soit des outils, des interfaces web conviviales ou des bases de données

  • Analyse de données génomiques, plus particulièrement destinée à la communauté du métaprogramme MEM

 

Pour les demandes de support envoyez un courrier à : help.migale@jouy.inra.fr
Pour des renseignements sur les cycles de formation : formation.migale@jouy.inra.fr
Pour l'inscription à la liste de diffusion : user-migale@listes.inra.fr

Si vous utilisez les ressources de la plateforme, pensez à la citer dans les remerciements en cas de publication scientifique et à nous l'indiquer grâce au formulaire mis à votre disposition.

 

Organisation de la plateforme

Organigramme

 

 

Distribution des compétences

 

  Gestion de projet Conception & Développement Banques et bases de données Administration système Formations
S. Dérozier  + +++ ++   +++
 V. Loux  +++ +++ ++ ++ +++
 V. Martin  + + +++ + ++
E. Montaudon + + + +++ +++
 O. Rué  + ++ +   +++
 V. Vidal  + + +++    

 

Pilotage

Le pilotage de la plateforme est assuré directement et indirectement par plusieurs types de structures qui ont des rôles différents :

  • l'unité MaIAGE apporte les compétences techniques, des financements, et les ressources humaines
  • les départements MIA et MICA  apportent des fonds (dotation globale de l'unité) et des postes
  • le centre de Jouy-en-Josas et éventuellement la région Île de France peuvent contribuer au développement de la plateforme (fonds pour l'achat de nouvelles machines, installation des salles de formation)
  • l'IFB coordonne les projets transversaux et apporte des fonds (dotation spécifique, projets…)
  • les instances de labelisation (CNOC, IBiSa) soutiennent la plateforme, apportent des ressources (financement, CDD) et une reconnaissance externe