Comment télécharger des fichiers de taille supérieure à 2 Go ?

L'interface Galaxy ne permet pas de télécharger des fichiers de taille supérieure à 2Go via l'upload traditionnel (outil "Upload File from your computer").

Plusieurs possibilités s'offrent donc à vous :

  • vos données sont accessibles via une URL : il vous suffit de mettre l'URL dans l'encadré "URL/Text:",
  • vos données sont accessibles via un serveur FTP : il vous suffit de mettre l'URL FTP dans l'encadré "URL/Text:".

Si ce sont des données personnelles non accessibles par le web, il faut les transférer sur notre serveur Migale dans votre espace de travail (exemple : /projet/ville/identifiant/).

Différents outils vous permettent de faire ceci facilement selon votre environnement :

Pour faire votre upload, vous n'utiliserez donc plus l'outil "Upload File from your computer" mais "Upload local File" où il faudra renseigner le chemin vers votre fichier dans "Path to file:" (exemple : /projet/ville/identifiant/file.fastq).

Remarques importantes :

  • les répertoires où se trouvent vos fichiers doivent être accessibles en lecture et exécution,
  • vos fichiers doivent être accessibles en lecture.

Pour toutes questions supplémentaires, veuillez contacter galaxy-help@jouy.inra.fr.

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