Florilege

Ces 30 dernières années, les laboratoires INRA et les CIRM ont accumulé et publié un grand nombre de phénotypes de bactéries et de levures issus du phénotypage de plusieurs souches cultivées en culture pure. Dans le cadre du groupe thématique Food du métaprogramme MEM, nous cherchons à modéliser et à prédire le rôle des bactéries, des levures et des champignons d'intérêt agro-alimentaire ou d'altération dans les aliments. Ce rôle passe en partie par les capacités des micro-organismes. Notre hypothèse de travail est qu'une meilleure connaissance des phénotypes de chaque souche de l'écosystème doit permettre de mieux appréhender le rôle du microbiote pendant l'élaboration et la conservation des aliments et son impact sur leur qualité sanitaire, organoleptique, fonctionnelle et nutritionnelle. Il n'existe pas à l'heure actuelle de base de données rassemblant ces informations.

L'objectif de ce projet est de construire une base de données de phénotypes de bactéries et de levures pouvant apporter des ressources pour la recherche et l'innovation en partant du besoin des chercheurs INRA travaillant en microbiologie alimentaire.

L'équipe Bibliome de l'unité MaIAGE est impliquée sur la mise en place d'outils de fouille de texte et la plateforme Migale est en charge de la construction de la base de données et de l'interface web.

Coordinateur : Hélène Falentin

Co-coordinateur : Claire Nédellec

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