Arrêt de l'ensemble des services de la plateforme Migale à partir du lundi 3 avril 2017

La plateforme Migale sera indisponible du 3 au 10 avril 2017. Cette indisponibilité est dûe à l'arrêt du DataCenter Ile-de-France qui héberge l'infrastructure de la plateforme.

Merci d'avance de votre compréhension.

Pour toutes questions ou informations supplémentaires, merci de contacter help.migale@jouy.inra.fr.

Comment connaitre le répertoire de travail de mes jobs ?

Je lance actuellement un grand nombre de jobs simultanément, chacun à partir d'un répertoire différent.
 
Y aurait-il moyen de savoir dans qstat quel est le répertoire de travail du job (ou celui où il a été lancé) ?

 

Pour un job donné, dont vous connaissez le jobid avec un qstat, vous pouvez utiliser le paramètre -j pour obtenir toutes les informations le concernant. Le paramètre cwd vous donne le répertoire d’où il a été lancé.
 
Exemple :
 
qstat -u vloux
9532500 0.00006 qsub_job.s vloux       r     02/20/2017 17:05:57 infinit.q@n92                      1
9533286 0.00006 qsub_job.s vloux       r     02/20/2017 17:20:12 infinit.q@n43                      1
9536801 0.00006 qsub_job.s vloux       r     02/20/2017 18:42:12 infinit.q@n51                      1
9536804 0.00006 qsub_job.s vloux       r     02/20/2017 18:43:57 infinit.q@n92                      1
9536808 0.00006 qsub_job.s vloux       r     02/20/2017 18:48:42 infinit.q@n51                      1
9538412 0.00006 qsub_job.s vloux       r     02/22/2017 17:16:39 infinit.q@n46                      1
9538413 0.00006 qsub_job.s vloux       r     02/22/2017 17:16:54 infinit.q@n77                      1
 
 
 qstat -j 9532500|grep cwd
cwd:                        /projet/versailles/work/vloux/cartoeure/outputs/20170220-170551TIntZoneDateGausSplitIntZoneDist
 
Et pour systématiser sur l’ensemble de vos jobs :
qstat -u vloux|awk '{print $1}'|xargs -t -n 1  qstat -j |grep cwd

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