Arrêt de l'ensemble des services de la plateforme Migale à partir du lundi 3 avril 2017

La plateforme Migale sera indisponible du 3 au 10 avril 2017. Cette indisponibilité est dûe à l'arrêt du DataCenter Ile-de-France qui héberge l'infrastructure de la plateforme.

Merci d'avance de votre compréhension.

Pour toutes questions ou informations supplémentaires, merci de contacter help.migale@jouy.inra.fr.

Langage Perl

Comment remplacer une chaîne de caractère par une autre dans un ou plusieurs fichiers en PERL ?

Les fichiers seront sauvegardés avec l'extension .bak, ce qui permet de revenir en arrière.

 #perl -pi.bak -e 's#ATTCTT#GGTAT#g' *.seq

Comment interfacer Perl et R ?

Il existe à minima 2 modules permettant d'éxécuter du code R sans passer par des appels de type system() depuis un programme PERL. Le premier RSperl n'est pas encore installé sur migale. Le second, Statistics::R, dont on trouvera un exemple ci-desous permet de répondre à certains besoins.

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by Dr. Radut