| Version | MAJ | agmial | ||
| 2004-10-12 | Download | Doc |
Agmial est une chaîne d'annotation de génomes microbiens, formée de deux modules indépendants. Le premier gère les séquences protéiques, le second les séquences nucléiques. Agmial soutient le principe que l'expert humain doit être placé au centre du processus d'annotation. Afin d'aider les annotateurs dans cette tache complexe et coûteuse en temps, le système est conçu pour automatiser au maximum le processus d'annotation et fournir des interfaces conviviales. Il implémente une stratégie d'annotation. Le système est capable de travailler sur des séquences non finies (draft) et il permet l'annotation collaborative par des équipes d'annotateurs. Il est basé sur des standards informatiques (services web, système de gestion de base de données relationnelles, Java, ...) et bioinformatiques. Le système est distribué sous licence GPL. Agmial est actuellement utilisé par plusieurs laboratoires de l'INRA pour l'annotation ou la réannotation de génomes d'interêt agro-alimentaire.
Remarque
| Run Unix # | Run Web # http://genome.jouy.inra.fr/public-agmial |
